V obci Všestary byly významné povodně v roce 2002, 2013 a 2016. Rizikovou oblastí je místní část Menčice spadající do k.ú. Všestary, které jsou ohroženy tokem Mnichovka. V níže položeném městě Mnichovice (cca 500m vzdušnou čarou), jsou doloženy četné povodně způsobené tímto tokem.
Povodně červen 2016
Při přívalových povodních 16. 6. 2016 došlo k vytopení zhruba čtyřech domů (č. p. 288) na návsi obce Všestary vlivem přívalového deště. Mimo materiálních škod došlo k úniku ropných látek (oleje) na pozemku jedné z provozujících firem.
Povodně 2016 v obci Všestary (č. p. 288)
Povodně 2016, zatopení cest v obci Všestary