Dle firmy Středočeské vodárny, a.s., Kladno, není na území města Kralupy nad Vltavou registrováno prostranství, kde by mohlo dojít k zatopení vývěrem z kanalizace ještě před zatopením prostoru z povrchu. Proto není kanalizační systém v případě zvýšených průtoků v tocích odstavován, ani nikde uzavírán či utěsňován. Jediný problém je registrován u kanalizačního systému odvodnění komunikace pod viaduktem, kde dochází k zatopení komunikace pod viaduktem a fakticky k rozdělení Kralup nad Vltavou na dvě poloviny bez možnosti spojení. Tento kanalizační systém ovšem není ve správě společnosti Středočeské vodárny, a.s.
U jednotlivých nemovitostí by mohlo dojít k zatopení podzemních prostor (sklepů) v případě zatopení kanalizačního systému a zároveň umístění např. „gulí“ k odvodnění podlah ve sklepích. Ovšem při zvýšených průtocích a zatopení systému kanalizace na levobřežní části na jaře roku 2006 (levobřežní systém kanalizace se zatápí jako první) nebyl tento problém registrován.
Dalšími nebezpečnými místy (nejsou ve správě SV a.s.) jsou: černý kanál pod nádražím a kanál v areálu stavebnin v Libušině ulici.
Při povodni 2013 došlo k zatopení území vývěrem z kanalizace před zatopením z povrchu! Foto dostupné na MěÚ.
